Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap1s2Q9DB50 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap1s2Q9DB50 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap1s2Q9DB50 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap1s2Q9DB50 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap1s2Q9DB50 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ap1s2Q9DB50 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ap1s2Q9DB50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ap1s2Q9DB50 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms