Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnn3Q9DAW9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn3Q9DAW9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn3Q9DAW9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn3Q9DAW9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn3Q9DAW9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn3Q9DAW9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnn3Q9DAW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms