Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc54Q9DAL3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc54Q9DAL3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc54Q9DAL3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc54Q9DAL3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc54Q9DAL3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc54Q9DAL3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc54Q9DAL3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms