Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem239Q9DA47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem239Q9DA47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem239Q9DA47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem239Q9DA47 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem239Q9DA47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem239Q9DA47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms