Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd8Q9DA37 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd8Q9DA37 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd8Q9DA37 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd8Q9DA37 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd8Q9DA37 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd8Q9DA37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd8Q9DA37 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd8Q9DA37 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd8Q9DA37 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd8Q9DA37 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd8Q9DA37 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd8Q9DA37 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms