Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bpifa3Q9D9J8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bpifa3Q9D9J8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bpifa3Q9D9J8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bpifa3Q9D9J8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bpifa3Q9D9J8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bpifa3Q9D9J8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bpifa3Q9D9J8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms