Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmco5aQ9D9D5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmco5aQ9D9D5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmco5aQ9D9D5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmco5aQ9D9D5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmco5aQ9D9D5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco5aQ9D9D5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco5aQ9D9D5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmco5aQ9D9D5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmco5aQ9D9D5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmco5aQ9D9D5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco5aQ9D9D5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco5aQ9D9D5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmco5aQ9D9D5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco5aQ9D9D5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5aQ9D9D5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms