Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgap3Q9D8S3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap3Q9D8S3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap3Q9D8S3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgap3Q9D8S3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgap3Q9D8S3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgap3Q9D8S3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgap3Q9D8S3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap3Q9D8S3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgap3Q9D8S3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap3Q9D8S3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arfgap3Q9D8S3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgap3Q9D8S3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgap3Q9D8S3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.4 ms