Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mrpl17Q9D8P4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mrpl17Q9D8P4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mrpl17Q9D8P4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mrpl17Q9D8P4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl17Q9D8P4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mrpl17Q9D8P4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl17Q9D8P4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl17Q9D8P4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl17Q9D8P4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mrpl17Q9D8P4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl17Q9D8P4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl17Q9D8P4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms