Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan13Q9D8C2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan13Q9D8C2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan13Q9D8C2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan13Q9D8C2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan13Q9D8C2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms