Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisa5Q9D7I0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Shisa5Q9D7I0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shisa5Q9D7I0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shisa5Q9D7I0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shisa5Q9D7I0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shisa5Q9D7I0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shisa5Q9D7I0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms