Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chmp4cQ9D7F7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chmp4cQ9D7F7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chmp4cQ9D7F7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chmp4cQ9D7F7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Chmp4cQ9D7F7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Chmp4cQ9D7F7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chmp4cQ9D7F7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp4cQ9D7F7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chmp4cQ9D7F7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms