Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc13Q9D548 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc13Q9D548 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc13Q9D548 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc13Q9D548 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc13Q9D548 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc13Q9D548 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc13Q9D548 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc13Q9D548 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc13Q9D548 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc13Q9D548 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc13Q9D548 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc13Q9D548 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1224 ms