Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrp2bpQ9D4C6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrp2bpQ9D4C6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrp2bpQ9D4C6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrp2bpQ9D4C6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrp2bpQ9D4C6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrp2bpQ9D4C6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrp2bpQ9D4C6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lrp2bpQ9D4C6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrp2bpQ9D4C6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp2bpQ9D4C6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrp2bpQ9D4C6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrp2bpQ9D4C6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrp2bpQ9D4C6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrp2bpQ9D4C6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms