Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cfap53Q9D439 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap53Q9D439 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap53Q9D439 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap53Q9D439 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap53Q9D439 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap53Q9D439 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cfap53Q9D439 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cfap53Q9D439 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfap53Q9D439 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfap53Q9D439 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfap53Q9D439 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfap53Q9D439 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfap53Q9D439 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfap53Q9D439 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfap53Q9D439 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfap53Q9D439 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap53Q9D439 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms