Protein–RNA interactions for Protein: Q9D306

Mgat4c, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat4cQ9D306 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgat4cQ9D306 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgat4cQ9D306 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat4cQ9D306 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mgat4cQ9D306 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mgat4cQ9D306 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mgat4cQ9D306 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mgat4cQ9D306 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mgat4cQ9D306 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mgat4cQ9D306 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mgat4cQ9D306 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat4cQ9D306 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mgat4cQ9D306 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgat4cQ9D306 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms