Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cysrt1Q9D1E4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cysrt1Q9D1E4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cysrt1Q9D1E4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cysrt1Q9D1E4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cysrt1Q9D1E4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cysrt1Q9D1E4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cysrt1Q9D1E4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cysrt1Q9D1E4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cysrt1Q9D1E4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cysrt1Q9D1E4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cysrt1Q9D1E4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms