Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R9

Wdr89, WD repeat-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr89Q9D0R9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Wdr89Q9D0R9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Wdr89Q9D0R9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wdr89Q9D0R9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wdr89Q9D0R9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Wdr89Q9D0R9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Wdr89Q9D0R9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Wdr89Q9D0R9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr89Q9D0R9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr89Q9D0R9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr89Q9D0R9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr89Q9D0R9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr89Q9D0R9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr89Q9D0R9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr89Q9D0R9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr89Q9D0R9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr89Q9D0R9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr89Q9D0R9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr89Q9D0R9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr89Q9D0R9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms