Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrto4Q9D0I8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrto4Q9D0I8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrto4Q9D0I8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrto4Q9D0I8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrto4Q9D0I8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrto4Q9D0I8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrto4Q9D0I8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrto4Q9D0I8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms