Protein–RNA interactions for Protein: Q9D073

2610042L04Rik, 2610042L04Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610042L04RikQ9D073 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2610042L04RikQ9D073 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2610042L04RikQ9D073 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
2610042L04RikQ9D073 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
2610042L04RikQ9D073 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2610042L04RikQ9D073 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
2610042L04RikQ9D073 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2610042L04RikQ9D073 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610042L04RikQ9D073 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610042L04RikQ9D073 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
2610042L04RikQ9D073 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610042L04RikQ9D073 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms