Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mdm1Q9D067 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdm1Q9D067 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdm1Q9D067 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mdm1Q9D067 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdm1Q9D067 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mdm1Q9D067 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mdm1Q9D067 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mdm1Q9D067 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mdm1Q9D067 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mdm1Q9D067 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdm1Q9D067 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mdm1Q9D067 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mdm1Q9D067 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdm1Q9D067 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdm1Q9D067 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms