Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc47Q9D024 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc47Q9D024 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc47Q9D024 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc47Q9D024 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc47Q9D024 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc47Q9D024 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc47Q9D024 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc47Q9D024 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc47Q9D024 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc47Q9D024 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc47Q9D024 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc47Q9D024 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc47Q9D024 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc47Q9D024 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc47Q9D024 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc47Q9D024 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc47Q9D024 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc47Q9D024 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc47Q9D024 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc47Q9D024 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc47Q9D024 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc47Q9D024 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc47Q9D024 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms