Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bud23Q9CY21 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bud23Q9CY21 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bud23Q9CY21 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bud23Q9CY21 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bud23Q9CY21 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bud23Q9CY21 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bud23Q9CY21 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bud23Q9CY21 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bud23Q9CY21 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bud23Q9CY21 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bud23Q9CY21 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bud23Q9CY21 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms