Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3300002I08RikQ9CXH3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
3300002I08RikQ9CXH3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3300002I08RikQ9CXH3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
3300002I08RikQ9CXH3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
3300002I08RikQ9CXH3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
3300002I08RikQ9CXH3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
3300002I08RikQ9CXH3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
3300002I08RikQ9CXH3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
3300002I08RikQ9CXH3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
3300002I08RikQ9CXH3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms