Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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