Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc96Q9CR92 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc96Q9CR92 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc96Q9CR92 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc96Q9CR92 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc96Q9CR92 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc96Q9CR92 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc96Q9CR92 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc96Q9CR92 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc96Q9CR92 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc96Q9CR92 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc96Q9CR92 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc96Q9CR92 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms