Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CR55 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CR55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CR55 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CR55 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CR55 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CR55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CR55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CR55 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CR55 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CR55 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CR55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CR55 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CR55 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CR55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CR55 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CR55 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CR55 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CR55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CR55 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CR55 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CR55 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CR55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CR55 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CR55 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CR55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CR55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CR55 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CR55 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CR55 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CR55 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CR55 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CR55 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CR55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CR55 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CR55 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CR55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CR55 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CR55 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CR55 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CR55 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CR55 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CR55 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CR55 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CR55 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CR55 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CR55 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CR55 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CR55 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CR55 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CR55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CR55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CR55 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CR55 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CR55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CR55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CR55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CR55 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CR55 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CR55 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CR55 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CR55 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CR55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CR55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CR55 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CR55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CR55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CR55 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CR55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CR55 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CR55 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CR55 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CR55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CR55 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CR55 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CR55 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CR55 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9CR55 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CR55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CR55 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CR55 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CR55 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CR55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CR55 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CR55 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CR55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CR55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CR55 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CR55 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9CR55 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CR55 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CR55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CR55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CR55 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CR55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CR55 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CR55 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CR55 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CR55 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CR55 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms