Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PsenenQ9CQR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PsenenQ9CQR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PsenenQ9CQR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PsenenQ9CQR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PsenenQ9CQR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms