Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Trim26Q99PN3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Trim26Q99PN3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Trim26Q99PN3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Trim26Q99PN3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim26Q99PN3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trim26Q99PN3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim26Q99PN3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim26Q99PN3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim26Q99PN3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim26Q99PN3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim26Q99PN3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim26Q99PN3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim26Q99PN3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim26Q99PN3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim26Q99PN3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim26Q99PN3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim26Q99PN3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim26Q99PN3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Trim26Q99PN3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim26Q99PN3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trim26Q99PN3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trim26Q99PN3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms