Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkd1Q99MH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkd1Q99MH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkd1Q99MH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nkd1Q99MH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkd1Q99MH6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkd1Q99MH6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkd1Q99MH6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkd1Q99MH6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkd1Q99MH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms