Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SncaipQ99ME3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SncaipQ99ME3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SncaipQ99ME3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SncaipQ99ME3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SncaipQ99ME3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SncaipQ99ME3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SncaipQ99ME3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SncaipQ99ME3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SncaipQ99ME3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SncaipQ99ME3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SncaipQ99ME3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SncaipQ99ME3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SncaipQ99ME3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SncaipQ99ME3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms