Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd2bQ99M03 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rwdd2bQ99M03 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rwdd2bQ99M03 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rwdd2bQ99M03 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rwdd2bQ99M03 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rwdd2bQ99M03 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd2bQ99M03 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms