Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS1

Mmadhc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmadhcQ99LS1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MmadhcQ99LS1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MmadhcQ99LS1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MmadhcQ99LS1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MmadhcQ99LS1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MmadhcQ99LS1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MmadhcQ99LS1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MmadhcQ99LS1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MmadhcQ99LS1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MmadhcQ99LS1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms