Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NgrnQ99KS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NgrnQ99KS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NgrnQ99KS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NgrnQ99KS2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgrnQ99KS2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgrnQ99KS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgrnQ99KS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NgrnQ99KS2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NgrnQ99KS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NgrnQ99KS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NgrnQ99KS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NgrnQ99KS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms