Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GatbQ99JT1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GatbQ99JT1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GatbQ99JT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GatbQ99JT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GatbQ99JT1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GatbQ99JT1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GatbQ99JT1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GatbQ99JT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GatbQ99JT1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms