Protein–RNA interactions for Protein: Q99J85

Nptxr, Neuronal pentraxin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NptxrQ99J85 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NptxrQ99J85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NptxrQ99J85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NptxrQ99J85 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NptxrQ99J85 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NptxrQ99J85 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NptxrQ99J85 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NptxrQ99J85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NptxrQ99J85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NptxrQ99J85 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NptxrQ99J85 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NptxrQ99J85 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NptxrQ99J85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NptxrQ99J85 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NptxrQ99J85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NptxrQ99J85 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NptxrQ99J85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NptxrQ99J85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NptxrQ99J85 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NptxrQ99J85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms