Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apobec3Q99J72 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Apobec3Q99J72 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Apobec3Q99J72 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apobec3Q99J72 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apobec3Q99J72 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apobec3Q99J72 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apobec3Q99J72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apobec3Q99J72 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apobec3Q99J72 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apobec3Q99J72 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apobec3Q99J72 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Apobec3Q99J72 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms