Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx18Q91ZR2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx18Q91ZR2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snx18Q91ZR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx18Q91ZR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx18Q91ZR2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx18Q91ZR2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx18Q91ZR2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx18Q91ZR2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms