Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP9

Necab2, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab2Q91ZP9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Necab2Q91ZP9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Necab2Q91ZP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Necab2Q91ZP9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Necab2Q91ZP9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Necab2Q91ZP9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Necab2Q91ZP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Necab2Q91ZP9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Necab2Q91ZP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Necab2Q91ZP9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Necab2Q91ZP9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Necab2Q91ZP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Necab2Q91ZP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Necab2Q91ZP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab2Q91ZP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Necab2Q91ZP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Necab2Q91ZP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Necab2Q91ZP9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Necab2Q91ZP9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Necab2Q91ZP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Necab2Q91ZP9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Necab2Q91ZP9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Necab2Q91ZP9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Necab2Q91ZP9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Necab2Q91ZP9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms