Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms