Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhac1Q91Y10 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhac1Q91Y10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhac1Q91Y10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhac1Q91Y10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhac1Q91Y10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhac1Q91Y10 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdhac1Q91Y10 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms