Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkal1Q91WE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkal1Q91WE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkal1Q91WE6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkal1Q91WE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkal1Q91WE6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdkal1Q91WE6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdkal1Q91WE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkal1Q91WE6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkal1Q91WE6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkal1Q91WE6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkal1Q91WE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkal1Q91WE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdkal1Q91WE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms