Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usb1Q91W78 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usb1Q91W78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usb1Q91W78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usb1Q91W78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usb1Q91W78 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usb1Q91W78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usb1Q91W78 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usb1Q91W78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usb1Q91W78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usb1Q91W78 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usb1Q91W78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usb1Q91W78 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usb1Q91W78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms