Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ8

Nprl3, GATOR complex protein NPRL3, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nprl3Q8VIJ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nprl3Q8VIJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nprl3Q8VIJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nprl3Q8VIJ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nprl3Q8VIJ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nprl3Q8VIJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nprl3Q8VIJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nprl3Q8VIJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nprl3Q8VIJ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nprl3Q8VIJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nprl3Q8VIJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nprl3Q8VIJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nprl3Q8VIJ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nprl3Q8VIJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nprl3Q8VIJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nprl3Q8VIJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nprl3Q8VIJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nprl3Q8VIJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms