Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE28

Nkd2, Protein naked cuticle homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd2Q8VE28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkd2Q8VE28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkd2Q8VE28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkd2Q8VE28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkd2Q8VE28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkd2Q8VE28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkd2Q8VE28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkd2Q8VE28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkd2Q8VE28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkd2Q8VE28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkd2Q8VE28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkd2Q8VE28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms