Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TgdsQ8VDR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TgdsQ8VDR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TgdsQ8VDR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TgdsQ8VDR7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TgdsQ8VDR7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TgdsQ8VDR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TgdsQ8VDR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TgdsQ8VDR7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TgdsQ8VDR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TgdsQ8VDR7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TgdsQ8VDR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TgdsQ8VDR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TgdsQ8VDR7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TgdsQ8VDR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TgdsQ8VDR7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TgdsQ8VDR7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TgdsQ8VDR7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TgdsQ8VDR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TgdsQ8VDR7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms