Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8VDP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q8VDP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8VDP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8VDP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8VDP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8VDP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8VDP2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8VDP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8VDP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8VDP2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8VDP2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8VDP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8VDP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8VDP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8VDP2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8VDP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8VDP2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8VDP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8VDP2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q8VDP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8VDP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms