Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubg2Q8VCK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubg2Q8VCK3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubg2Q8VCK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubg2Q8VCK3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubg2Q8VCK3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubg2Q8VCK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubg2Q8VCK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubg2Q8VCK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubg2Q8VCK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubg2Q8VCK3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubg2Q8VCK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubg2Q8VCK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubg2Q8VCK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubg2Q8VCK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms