Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh10Q8VCH7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh10Q8VCH7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh10Q8VCH7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh10Q8VCH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh10Q8VCH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh10Q8VCH7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms