Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SdsQ8VBT2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SdsQ8VBT2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SdsQ8VBT2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SdsQ8VBT2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SdsQ8VBT2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SdsQ8VBT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SdsQ8VBT2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SdsQ8VBT2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SdsQ8VBT2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SdsQ8VBT2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SdsQ8VBT2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SdsQ8VBT2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SdsQ8VBT2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SdsQ8VBT2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SdsQ8VBT2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.08■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SdsQ8VBT2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SdsQ8VBT2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SdsQ8VBT2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SdsQ8VBT2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SdsQ8VBT2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SdsQ8VBT2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SdsQ8VBT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SdsQ8VBT2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SdsQ8VBT2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SdsQ8VBT2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SdsQ8VBT2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms